自行開車
1.國道1號-五甲系統交流道-省道臺88線-萬丹交流道下-省道臺27線-省道臺17線-縣道187線-博愛街-朝隆路-東港碼頭-搭船-小琉球。
2.國道3號-林邊交流道下-省道臺17線-縣道187線-鄉道屏63線-朝隆路-東港碼頭-搭船-小琉球。
將機車與人運至小琉球,島上並提供機車出租服務。
大眾運輸
1.搭飛機至高雄站下或搭臺鐵至高雄站下-轉搭墾丁列車(9117路-往墾丁)至屏客東港站下。
2.搭臺鐵至高雄站下-轉搭墾丁列車(9127路-往大鵬灣)至屏客東港站下。
3.搭臺鐵至屏東站下-轉搭屏東客運(往東港)至東港碼頭站下。 東港碼頭-搭船-小琉球。
1.東港-小琉球 (1)公營交通船:東港(08)833-7493;小琉球(08)861-1825。 (2)民營交通船:(08)832-5806。 (船班資訊 http://www.liuchiu.gov.tw/main-c-d-2.htm )